Polarimetric and spectral imaging approaches for quantitative characterization of inhomogeneous scattering media including biotissues |
|
Author: | Peyvasteh, Motahareh1,2 |
Organizations: |
1University of Oulu Graduate School 2University of Oulu, Faculty of Information Technology and Electrical Engineering |
Format: | ebook |
Version: | published version |
Access: | open |
Online Access: | PDF Full Text (PDF, 2.6 MB) |
Persistent link: | http://urn.fi/urn:isbn:9789526230443 |
Language: | English |
Published: |
Oulu : University of Oulu,
2021
|
Publish Date: | 2021-09-23 |
Thesis type: | Doctoral Dissertation |
Defence Note: | Academic dissertation to be presented with the assent of the Doctoral Training Committee of Information Technology and Electrical Engineering of the University of Oulu for public defence in the Saalasti Hall, Linnanmaa, on 30 September 2021, at 12 noon |
Tutor: |
Professor Igor Meglinski Professor Alexey Popov Docent Aliaksandr Bykau |
Reviewer: |
Professor Bernhard Wilhelm Roth Doctor Sergey Alexandrov |
Opponent: |
Doctor Iurii N. Zakharov |
Description: |
AbstractIn this thesis, light-tissue interaction was investigated through different experimental and analytical methodologies to analyze optical and polarization properties over time and the obtained results were utilized in biomedical and food science applications. In this thesis, soft biological tissues (pork samples) were selected as a biological tissue due to their similarity to human tissue. First, the relative spectral changes of absorbance were studied by applying two different custom-built configurations. A Monte Carlo modelling and principal component analysis (PCA) method were applied further to the absorbance dataset to provide thorough studies for a spectroscopic approach. Second, a novel application of Mueller matrix (MM) imaging polarimetry was pioneered to visualize the dynamics of the tissue polarization properties over time with a custom-built Mueller matrix imaging polarimeter (MMIP). Frequency distribution histograms (FDHs) and the changes in the statistical moments of the MM elements were analyzed over time to provide qualitative and quantitative information of the tissue polarization properties. Finally, a new Stokes-polarimetry was introduced to examine optically thin histological sections from optically anisotropic biological tissues with different morphological structures. In summary, in spectroscopic and imaging polarimetry approaches, prominent changes in optical properties of the examined soft biological tissues were discriminated over time. The obtained results are promising in the development of a novel non-destructive tool for monitoring biological tissues for application in biomedical applications and the food industry. The Stokes-polarimetry method can provide a comparative analysis of different polarimetric techniques and prove the diagnostic potential of Stokes correlometry of pathological changes in the orientation-phase structure of biological tissues. see all
TiivistelmäTässä opinnäytetyössä valon ja kudoksen vuorovaikutusta tutkittiin erilaisilla kokeellisilla ja analyyttisillä menetelmillä, jotta voitiin tunnistaa optisten ja polarisaatio-ominaisuuksien alkuvaiheita ja hyödyntää saatuja tuloksia biolääketieteellisissä ja elintarviketieteellisissä sovelluksissa. Tässä työssä pehmeäksi biologiseksi kudokseksi valittiin sianlihanäytteet niiden ja ihmiskudoksen samankaltaisuuden vuoksi. Ensiksi pehmeiden biologisten kudosten absorbanssin suhteellisia spektrimuutoksia tutkittiin soveltamalla kahta erilaista räätälöityä kokoonpanoa, jotka yhdistettiin. Monte Carlon mallintamista ja pääkomponenttianalyysimenetelmää (PCA) sovellettiin edelleen absorbanssiaineistoon, jota voitiin perusteellisesti tutkia spektroskooppisesti. Toiseksi Mueller-matriisin (MM) kuvantamispolarimetrian uudella sovelluksella pyrittiin visualisoimaan kudosten polarisaatio-ominaisuuksien dynamiikkaa ajan suhteen räätälöidyllä Mueller-matriisikuvauspolarimetrillä (MMIP). Taajuusjakauman histogrammit (FDH) ja MM-elementtien tilastolliset momenttimuutokset analysoitiin ajan suhteen, jotta saataisiin kvalitatiivista ja kvantitatiivista tietoa kudosten polarisaatio-ominaisuuksista. Lopuksi otettiin käyttöön uusi Stokesin polarimetrinen menetelmä, jotta voitiin tutkia optisesti ohuita histologisia leikkauksia anisotrooppisista biologisista kudoksista, joilla on erilainen morfologinen rakenne. Yhteenvetona voidaan todeta, että spektroskooppisesti ja kuvantamispolarimetrillä tutkittujen pehmeiden biologisten kudosten optisten ominaisuuksien huomattavat muutokset erotettiin selvästi ajan suhteen. Saadut tulokset ovat lupaavia, kun kehitetään uutta ainetta rikkomatonta työkalua biologisten kudosten seurantaan biolääketieteellisissä sovelluksissa ja elintarviketeollisuudessa. Stokesin polarimetrisella menetelmällä voidaan tuottaa vertaileva analyysi erilaisista polarimetrisistä tekniikoista ja todistaa Stokesin korrelometrian diagnostinen potentiaali biologisten kudosten orientaatiovaiheen rakenteessa. see all
Osajulkaisut / Original papersOsajulkaisut eivät sisälly väitöskirjan elektroniseen versioon. / Original papers are not included in the electronic version of the dissertation.
see all
|
Series: |
Acta Universitatis Ouluensis. C, Technica |
ISSN: | 0355-3213 |
ISSN-E: | 1796-2226 |
ISSN-L: | 0355-3213 |
ISBN: | 978-952-62-3044-3 |
ISBN Print: | 978-952-62-3043-6 |
Issue: | 799 |
Type of Publication: |
G5 Doctoral dissertation (articles) |
Field of Science: |
114 Physical sciences |
Subjects: | |
Funding: |
I would like to acknowledge the financial support provided by the I4Future program (Marie Skłodowska-Curie grant No.713606, 643417), the CIMO foundation (TM-15-9636), Cost (European Cooperation in Science and Technology) Action (CA16118) and University of Oulu Scholarship Fund |
EU Grant Number: |
(713606) I4FUTURE - Novel Imaging and Characterisation Methods in Bio, Medical, and Environmental Research and Technology Innovations |
Copyright information: |
© University of Oulu, 2021. This publication is copyrighted. You may download, display and print it for your own personal use. Commercial use is prohibited. |