Kasvien reagointi mutualistisiin ja patogeenisiin sieniin
Varjo, Taru (2022-06-16)
Varjo, Taru
T. Varjo
16.06.2022
© 2022 Taru Varjo. Ellei toisin mainita, uudelleenkäyttö on sallittu Creative Commons Attribution 4.0 International (CC-BY 4.0) -lisenssillä (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/). Uudelleenkäyttö on sallittua edellyttäen, että lähde mainitaan asianmukaisesti ja mahdolliset muutokset merkitään. Sellaisten osien käyttö tai jäljentäminen, jotka eivät ole tekijän tai tekijöiden omaisuutta, saattaa edellyttää lupaa suoraan asianomaisilta oikeudenhaltijoilta.
Julkaisun pysyvä osoite on
https://urn.fi/URN:NBN:fi:oulu-202206162953
https://urn.fi/URN:NBN:fi:oulu-202206162953
Tiivistelmä
Kasvit muodostavat maaperän mikrobien kanssa sekä hyödyllisiä että haitallisia suhteita. Yhteiselo niiden välillä on saanut alkunsa kasvien levittäytyessä maalle satoja miljoonia vuosia sitten. Kasvien pitää osata puolustautua haitallisia mikrobeja vastaan ja samalla tukea hyödyllisiä suhteita. Kaikki mutualistiset suhteet eivät ole kehittyneet samaan aikaan ja niiden kehitystä pystytään seuraamaan fossiililöytöjen avulla. Sekä mutualistisia että patogeenisiä suhteita on kolme. Miten kasvit erottavat ne toisistaan ja reagoivat kuhunkin suhteeseen on tämän tutkielman aihe.
MAMP-käynnisteisessä immuniteetissä kasvit tunnistavat sienien soluseinissä olevia rakennemolekyylejä erilaisilla reseptoreilla omien solujensa soluseinissä. Kitiini, glukaanit ja flagelliinit käydään läpi tarkemmin, pureutuen niiden rakenteisiin ja aiheuttamiin signalointikaskadeihin. Esittelen myös MAMP-käynnisteisen immuniteetin aiheuttamat reaktiot kasveissa, kuten happiradikaalien tuotannon ja PR-proteiinien synteesin. Näihin tutustutaan tutkielman myöhemmissä luvuissa tarkemmin.
MAMP-käynnisteistä immuniteettiä nopeampi ja voimakkaampi puolustusvaste on vaikuttajakäynnisteinen immuniteetti, joka johtaa useimmiten hypersensitiiviseen vasteeseen. Tälle olen keskittänyt aivan oman kappaleen, sen ollessa yksi tärkeimmistä puolustusvasteista biotrofisia ja hemibiotrofisia patogeenejä vastaan. Vaikuttajakäynnisteiseen immuniteettiin kuuluvat isona osana myös resistenssigeenien koodaamat NBS-LRR-proteiinit, jotka ovat olennainen osa patogeenien tunnistamisessa.
Tutkielmassa myöhäisten vasteiden osalta käsitellään kasvihormonit ja niiden tuottamat PR-proteiinit sekä miten ne vaikuttajat kasveissa sienikolonisaatioiden aikana. Hieman yllättäen tutkielman tekemisen aikana mielenkiintoisimmaksi aiheeksi nousi mikro-RNA:t ja niiden monipuolinen toiminta geeniensäätelyssä.
Lopuksi kokoan reagointitavat yhteen ja pohdin, minkä aihealueiden tutkiminen edesauttaisi kasvien puolustautumismekanismien yleistä ymmärrystä parhaiten.
MAMP-käynnisteisessä immuniteetissä kasvit tunnistavat sienien soluseinissä olevia rakennemolekyylejä erilaisilla reseptoreilla omien solujensa soluseinissä. Kitiini, glukaanit ja flagelliinit käydään läpi tarkemmin, pureutuen niiden rakenteisiin ja aiheuttamiin signalointikaskadeihin. Esittelen myös MAMP-käynnisteisen immuniteetin aiheuttamat reaktiot kasveissa, kuten happiradikaalien tuotannon ja PR-proteiinien synteesin. Näihin tutustutaan tutkielman myöhemmissä luvuissa tarkemmin.
MAMP-käynnisteistä immuniteettiä nopeampi ja voimakkaampi puolustusvaste on vaikuttajakäynnisteinen immuniteetti, joka johtaa useimmiten hypersensitiiviseen vasteeseen. Tälle olen keskittänyt aivan oman kappaleen, sen ollessa yksi tärkeimmistä puolustusvasteista biotrofisia ja hemibiotrofisia patogeenejä vastaan. Vaikuttajakäynnisteiseen immuniteettiin kuuluvat isona osana myös resistenssigeenien koodaamat NBS-LRR-proteiinit, jotka ovat olennainen osa patogeenien tunnistamisessa.
Tutkielmassa myöhäisten vasteiden osalta käsitellään kasvihormonit ja niiden tuottamat PR-proteiinit sekä miten ne vaikuttajat kasveissa sienikolonisaatioiden aikana. Hieman yllättäen tutkielman tekemisen aikana mielenkiintoisimmaksi aiheeksi nousi mikro-RNA:t ja niiden monipuolinen toiminta geeniensäätelyssä.
Lopuksi kokoan reagointitavat yhteen ja pohdin, minkä aihealueiden tutkiminen edesauttaisi kasvien puolustautumismekanismien yleistä ymmärrystä parhaiten.
Kokoelmat
- Avoin saatavuus [31941]